...

1. uruchomienie sesji graficznej pro-viz

   Code Block
   language bash title uruchomienie sesji pro-viz
   # załadowanie modułu pro-viz #klaster ares module add pro-viz #klaster prometheus module add tools/pro-viz # zlecenie sesji graficznej: 1 węzeł x 4 rdzenie na 8 godzin pro-viz start -N1 -n4 -t 8:00:00 # sprawdzenie czy sesja graficzna się uruchomiła pro-viz list # ustawienie hasła dla sesji pro-viz password <jobid>

   W momencie kiedy ustawione zostanie hasło, należy zestawić sesje graficzną poprzez klienta VNC. Opis postępowania dostępny jest w sekcji: Obliczenia w trybie graficznym: pro-viz

2.  załadowanie modułu ansys

   Code Block
   language bash title ładowanie modułów ANSYS
   # załadowanie modułu pro-viz #klaster ares module load ansys #klaster prometheus module add testplgrid/apps/ansys/18.2 # opcjonalnie dla szybkiego renderingu (przyspiesza operacje graficzne na modelach 3d) #klaster prometheus module add plgrid/libs/mesa/17.1.0

   
   

3. konfiguracja RSM (krok wykonuje się jednorazowo)

   klaster Zeus

   Code Block
   language bash title konfigurator RSM dla ANSYS
   # uruchomienie konfiguratora RSM /software/local/ansys/v182/CYFRONET/rsm/setup_rsm

   klaster Prometheus

   Code Block
   language bash title konfigurator RSM dla ANSYS
   # uruchomienie konfiguratora RSM /net/software/local/ansys/cyfronet/v182/setup_rsm

   uruchomienie  workbench

   Code Block
   language bash title konfigurator RSM dla ANSYSUruchamiania w trybie graficznym
   # uruchomienie workbench runwb2 # alternatywnie w przypadku załadowania modułu mesa w punkcie 2.: runwb2 -oglhw

Tryb RSM

Tryb RSM - remote solve manager umożliwia zlecenie zadania na klaster z poziomu sesji graficznej ANSYS workbench.

Pakiet ANSYS pozwala na wysłanie całości projektu do przeliczenia poprzez mechaznim RSM lub wybranych solverów.

Uwaga: obliczenia wymagające wysłania całości projektu w ramach RSM obejmują

• static structural
• system coupling

Wysłanie całości projektu do RSM wymaga:

• przestawienia solverów w tryb default Solution>Properties>Solution Process>Update Option: Use Application Default
• ustawienia Solution Process dla Project Schematic na RSM (preferencje pojawiają sie po wybraniu Properties w menu kontekstowym po kliknięciu prawym klawiszem na białym polu okna project schematic)

Należy pamiętać o zapisaniu projektu po zleceniu zadania do RSM a przed zamknięciem sesji graficznej.

RSM: przetestowane moduły

Pakiet ANSYS jest złożonym produktem zbudowanym z wielu komponentów.
Tryb RSM może nie być wspierany dla wszystkich z nich lub może nie działać prawidłowo w naszym środowisku.
Komponenty z listy poniżej zostały przetestowane w trybie jedno i wielo węzłowym w trybie RSM:

• Fluent
• CFX
• Ansys
• Static structural (mogą pojawić się problemy w trybie wielowęzłowym - zalecane jest używanie trybu Shared Memory Parallel w ustawieniach solvera)

Jeżeli używany przez państwa komponent nie pojawia się na w/w liście prosimy o sprawdzenie jego działania i informacje w przypadku napotkanych problemów

Kolejki obliczeniowe

W trybie zlecenia zadań do systemu kolejkowego dostępne są następujące rodzaje kolejek.
Wybór kolejki powinien zależeć od prognozowanego czasu obliczeń.

Kolejki plgrid-short charakteryzują się szybszym czasem uruchomienia dzięki mechanizmowi backfill ale posiadają ograniczenie czasowe czasu trwania zadania

Kolejka AMD polecana jest dla zadań z większymi wymaganiami pamięci na rdzeń.

Kolejki dostępne na klastrze

...

Ares

Kolejki dostępne na klastrze Prometheus

...

Znane błędy

FLUENT: sched_setaffinity() call failed: Invalid argument

...

W środowisku slurm za izolację rdzeni odpowiada mechanizm cgroups, a przypinanie procesów do rdzeni realizowane jest przez biblioteki MPI.
Komunikat  ma wartość informacyjną i nie ma wpływu na wydajność obliczeń

Problem w wysyłaniem zadania w trybie RSM

Może się zdarzyć że po wybraniu opcji Update na solverze lub w całym projekcie Workbench oczekuje w nieskonczoność na reakcje RSM, a w oknie Job Monitora (przycisk w prawym dolnym rógu) nie pojawia się oczekiwane zadanie.
Problem związany jest z istnieniem pliku lock z poprzedniej sesji ANSYS. W celu naprawienia problemu uruchamiamy okno terminala i usuwamy niepotrzebny lock-file:

rm  ~/.ansys/v182/RSM/Jobs/$USER/DirectoryLocker.lock

...

Jeżeli workbench został zamknięty w czasie gdy w trybie RSM oczekiwał na zakonczenie zleconego zadania, to po ponowym uruchomieniu workbencha należy kliknąć przycisk Reconnect zlokalizowany w lewym górnym rogu ekranu aby pobrać przeliczone wyniki.

Zgłaszanie problemów w działaniu oprogramowania

...

• w czasie wystąpienia problemu nie została przekroczona quota dyskowa. Informacje otrzyujemy wywołując na maszynie dostępowej klastra (zeus.cyfronet.pl / pro.cyfronet.pl)  polecenie:

  Code Block
  language bash title raport użycia systemów plikowych
  # klaster zeus: zeus#klaster ares hpc-fs # klaster prometheus: pro-fs

  
  

• użytkownik posiada aktywny grant obliczeniowy

  Code Block
  language bash title raport użycia godzin w grancie
  #klaster ares hpc-grants #klaster prometheus plg-show-grants plg-show-grant-details <grant_name>

  
  

...