Obliczenia GPGPU to wykorzystanie procesorów graficznych wspólnie z jednostką CPU do przyspieszenia obliczeń naukowych i inżynierskich. Infrastruktura PL-Grid oferuje swoim użytkownikom dostęp do maszyny zawierającej karty GPGPU.Jest to Zeus CPGPU w ACK CYFRONET AGH. Zeus GPGPU jest grupą serwerów obliczeniowych zawierających karty GPGPU udostępnianych użytkownikom poprzez system kolejkowy.Obecnie w Zeusie GPGPU dostępne dla użytkowników są 504 rdzenie obliczeniowe, 204 karty GPGPU oraz 3,5 TB pamięci operacyjnej.
| Uwaga: |
Dostęp do GPGPU jest możliwy jednie z poziomu systemu kolejkowego klastra Zeus. Należy zatem najpierw uzyskać dostęp do lokalnego systemu kolejkowego na klastrze Zeus w ACK CYFRONET AGH, aktywując w portalu użytkownika odpowiednie usługi (wskazane jako "usługi nadrzędne").
Następnie należy wypełnić motywację i aplikować o usługę.
Przykładowe skrypty dla systemu kolejkowego
#!/bin/sh # TeraChem can run on a single node only #PBS -l nodes=1:ppn=2:terachem:gpus=2:exclusive_process #PBS -N sample_terachem #PBS -q gpgpu cd $PBS_O_WORKDIR # initializing proper environment for TeraChem module add gpu/terachem # actual job $TERACHEMRUN ch.inp > ch.log |
#!/bin/sh #PBS -l nodes=3:ppn=12:gpus=2:shared #PBS -N sample_namd #PBS -q gpgpu cd $PBS_O_WORKDIR # initializing proper environment for NAMD with GPU support module add gpu/namd # actual job runnamd stmv.namd > stmv2_2x2.log |
#!/bin/sh # the number of GPUs requested # at the moment it must be set to 2 per node #PBS -l nodes=2:ppn=4:gpus=2:exclusive_process #PBS -N sample_gamess #PBS -q gpgpu # changing directory to the one from which the job is submitted cd $PBS_O_WORKDIR # initializing proper environment for GAMESS with GPU support module add gpu/gamess # actual job rungms noq15 >& noq15.log |