Wtyczkami napisanymi w Matlab, są odpowiednie skrypty napisane w języku Matlab, zawierające informacje potrzebne do rozpoznania ich jak moduły dla SWIP5 i umieszczone w podkatalogu Matlab. Skrypty te będą widoczne, jako pozycje w menu programu SWIP5, których wybranie powoduje przesłanie odpowiednich danych do programu Matlab, wykonanie zadanego programu i przekazanie odpowiednich danych z powrotem do programu SWIP5. Są to typowe skrypty Matlaba poprzedzone definicjami dla SWIP, które są odpowiednimi liniami na początku skryptu traktowanymi przez Matlab, jako komentarze. Linie te są poprzedzone znakami "% !"Na ich podstawie podstawie program SWIP5 rozpoznaje je, jako funkcje dla programu SWIP5, umieszcza w odpowiednich pozycjach menu, przekazuje i odbiera odpowiednie dane z programu Matlab.Skrypty te mogą być wywoływane w programie Matlab bez pośrednictwa SWIP-a, co pozwala je testować przed dodaniem do programu.
Skrypt taki musi zaczynać się linią:
% !SWIP5
informującą program, że jest to skrypt przeznaczony dla programu SWIP5. Następnie musi wystąpić jedna, lub kilka linii opisujących menu:
% !MENU … ,
a następnie kilka linii opisujących sposób przekazywania danych miedzy SWIP5 a Matlab. Oczywiście w przypadku testowania skryptów w samym Matlabie dane trzeba wczytać przed wywołaniem skryptu. Można korzystać w skryptach z innych bibliotek, ale trzeba zdefiniować do nich dostęp.