Wtyczkami napisanymi w Matlab, są odpowiednie skrypty napisane w języku Matlab, zawierające informacje potrzebne do rozpoznania ich jak moduły dla SWIP5 i umieszczone w podkatalogu Matlab. Skrypty te będą widoczne, jako pozycje w menu programu SWIP5, których wybranie powoduje przesłanie odpowiednich danych do programu Matlab, wykonanie zadanego programu i przekazanie odpowiednich danych z powrotem do programu SWIP5. Są to typowe skrypty Matlaba poprzedzone definicjami dla SWIP, które są odpowiednimi liniami na początku traktowanymi przez Matlab, jako komentarze. Na ich podstawie podstawie program SWIP5 rozpoznaje je, jako funkcje dla programu SWIP5, umieszcza w odpowiednich pozycjach menu, przekazuje i odbiera odpowiednie dane z programu Matlab.Skrypty te mogą być wywoływane w programie Matlab bez pośrednictwa SWIP-a, co pozwala je testować przed dodaniem do programu.