Versions Compared

Old Version 37

changes.mady.by.user Unknown User (plgwielgus)

Saved on

compared with

New Version 38

changes.mady.by.user Maciej Czuchry

Saved on

Key

  • This line was added.
  • This line was removed.
  • Formatting was changed.

...

Lokalizacja

ACK CYFRONET AGH 

Nazwa systemu Zeus GPGPU
Nazwa maszyny dostępowej ui.cyfronet.pl
Port dostępowy 22
Liczba rdzeni obliczeniowych

504

Liczba kart GPU204
Kolejkagpgpu
OprogramowanieTeraChem, Gromacs, NAMD, GAMESS
Opis konfiguracji zasobów obliczeniowychwww.plgrid.pl/oferta/zasoby_obliczeniowe/opis_zasobow/HPC
Opis systemów składowania danychwww.plgrid.pl/oferta/zasoby_obliczeniowe/opis_zasobow/storage
Informacje rozszerzonekdm.cyfronet.pl/portal/Zeus_GPGPU
Kontakt cyfronet-lcg2@helpdesk.plgrid.pl

...

Code Block
titleTeraChem (zrównoleglenie na dwie karty graficzne)
#!/bin/sh

# TeraChem can run on a single node only
#PBS -l nodes=1:ppn=2:terachem:gpus=2:exclusive_process

#PBS -N sample_terachem
#PBS -q gpgpu

cd $PBS_O_WORKDIR

# initializing proper environment for TeraChem
module add gpu/terachem

# actual job
$TERACHEMRUN ch.inp > ch.log
Code Block
titleNANDNAMD
#!/bin/sh

#PBS -l nodes=3:ppn=12:gpus=2:shared
#PBS -N sample_namd
#PBS -q gpgpu

cd $PBS_O_WORKDIR

# initializing proper environment for NAMD with GPU support
module add gpu/namd

# actual job
runnamd stmv.namd > stmv2_2x2.log

...