Fazy można zaznaczać na wybranej trasie w oknie głównym lub w oknie powiększenia za pomocą kliknięcia myszką. Można również stworzyć fazę w oknie opracowania ręcznie opisując czas.
Wskazania fazy można wyznaczać na kanałach oryginalnych i przefiltrowanych. Rozpoczęcie oznaczania faz można zrobić na kilka sposobów:
- Poprzez kliknięcie na ikonę wyboru fazy Phase
na pasku narzędzi w oknie głównym lub jedną z ikon wyboru najczęściej wybieranych faz np. 
, 
(maksymalnie na pasku narzędzi może być do pięciu takich ikon, ich układ może się zmieniać w trakcie pracy z programem). - Poprzez wybranie opcji Pick phaze (zaznacz fazę) z menu rozwijanego
dostępnego po kliknięciu prawym klawiszem myszki 
nad danym seismogramem .
Fazę zaznacza się poprzez kliknięcie myszką 
w wybrane miejsce na sejsmogramie w oknie głównym lub w oknie powiększenia, zaznaczanie kończy się poprzez podwójne kliknięcie prawym klawiszem myszki.
W przypadku zaznaczenie faz w oknie głównym, w oknie powiększenia wyświetlany jest rozciągnięty odcinek sejsmogramu z zaznaczoną fazą i można fazę zaznaczyć bardziej precyzyjnie. Zaznaczone fazy jako Pick zostają wpisane do opracowania.
W celu zaznaczenia fazy na kolejnym sejsmogramie wystarczy w niego kliknąć dwa razy.
Istnieje również możliwość zdefiniowania wyboru kolejnej fazy do zaznaczania w pliku konfiguracyjnym faz (patrz konfiguracja). Nowa faza jest wybierana automatycznie po zaznaczeniu wcześniejszej, np . można ustawić, że po zaznaczeniu fazy P jest wybierana do zaznaczenia faza S. Dla przykładowych danych z rejonu 'Song Tranch 2' po ustawieniu fazy fali P (kliknięcie myszką), automatycznie ustawia się możliwość ustawienia fali S.
Rys 1. Zaznaczanie faz
Ustawienie opisu wejścia i polaryzacji fali
Istnieje możliwość ustawienia rodzaju wejścia fali Onset (Wejście fali) i Polarity (Polaryzacja). Odpowiednie menu można wywołać w następujący sposób → podczas wyboru fazy przyciskiem Phase na pasku narzędzi w oknie głównym lub podczas wyboru opcji Pick phase z menu rozwijanego → dostępnego po kliknięciu prawym przyciskiem myszkina dany sejsmogram.
W oknie tym można wybrać:
- Phase (Fazę), z listy nazw dopuszczalnych dla danego regionu (patrz konfiguracja).
- Onset (Wejście fali) → Emergent (), Impulsive (), Questionable ()
- Polarity (Polaryzacja) → Positive (Dodatnia), Negative (Ujemna), Undecidable (Nieokreślona).
Wprowadzone zmiany należy zatwierdzić poprzez kliknięcie przycisku OK.
Wybierając fazę przez jedną z ikon wyboru najczęściej wybieranych faz nie mamy możliwości ustawienia wejścia i polaryzacji fali. Przyjmowane są wartości domyślne.
Rys. 7 Okno wyboru fazy sejsmicznej
Edycja lub usuwanie fazy
Po ustawieniu fazy można ją usunąć lub wyedytować : tj. zmienić nazwę fazy, opis wejścia lub polaryzację fali. Nazwę fazy można zmienić na dowolną inną nazwę, nawet jeżeli nie jest ona na liście zdefiniowanych faz. Istnieją dwa sposoby edycji fazy:
- W oknie głównym lub oknie powiększenia poprzez wybranie opcji Edit phase ... (Edytuj fazę ...), w miejscu ... pojawi się nazwa zaznaczonej fazy, z menu rozwijanego
→ dostępnego po kliknięciu prawym przyciskiem myszkina danym sejsmogramie w oknie głównym lub oknie powiększenia.
Jeżeli w rozwijanym menu nie pojawi się pozycja edycji danej fazy), to może oznaczać, że pozycja myszki była za daleko od jej znacznika. W takiej sytuacji zalecane jest rozciągnięcie sejsmogramu i powtórne wybranie fazy do edycji. - W oknie opracowania poprzez edycję poszczególnych składowych zaznaczonej fazy wybranie Przez wybranie czynności – kliknięcie . Edycja lub usunięcie ustawionej fazy jest możliwe poprzez wybranie odpowiedniej opcji z rozwijanego menu (przykład na rys. 9) po kliknięciu prawym przyciskiem myszki na fazie sejsmicznej w oknie opracowania, następnie na wybraniu czynności z rozwijanego menu, przy czym czynności te można wykonywać na pozycji fazy (Pick) lub jej pozycjach składowych (Phase Hint, Onset, Polarity). na pozycji Phase Hint (Oznaczenie fazy), Onset (Wejścia fali) lub Polarity (Polaryzacji fali).
Rys. 8 Okno edycji fazy sejsmicznej
Rys. 9
Usuwanie fazy
Istnieją dwa sposoby usuwania fazy: