Fazy można zaznaczać na wybranej trasie w oknie głównym lub w oknie powiększenia za pomocą kliknięcia myszką. Można również stworzyć fazę w oknie opracowania ręcznie opisując czas.
Wskazania fazy można wyznaczać na kanałach oryginalnych i przefiltrowanych. Rozpoczęcie oznaczania faz można zrobić na kilka sposobów:
- Poprzez kliknięcie na ikonę wyboru fazy Phase
na pasku narzędzi w oknie głównym lub jedną z ikon wyboru najczęściej wybieranych faz np. 
, 
(maksymalnie na pasku narzędzi może być do pięciu takich ikon, ich układ może się zmieniać w trakcie pracy z programem). - Poprzez wybranie opcji Pick phaze (zaznacz fazę) z menu rozwijanego
dostępnego po kliknięciu prawym klawiszem myszki 
nad danym seismogramem .
Fazę zaznacza się poprzez kliknięcie myszką 
w wybrane miejsce na sejsmogramie w oknie głównym lub w oknie powiększenia, zaznaczanie kończy się poprzez podwójne kliknięcie prawym klawiszem myszki.
W przypadku zaznaczenie faz w oknie głównym, w oknie powiększenia wyświetlany jest rozciągnięty odcinek sejsmogramu z zaznaczoną fazą i można fazę zaznaczyć bardziej precyzyjnie. Zaznaczone fazy jako Pick zostają wpisane do opracowania.
W celu zaznaczenia fazy na kolejnym sejsmogramie wystarczy w niego kliknąć dwa razy.
Istnieje również możliwość zdefiniowania wyboru kolejnej fazy do zaznaczania w pliku konfiguracyjnym faz (patrz konfiguracja). Nowa faza jest wybierana automatycznie po zaznaczeniu wcześniejszej, np . można ustawić, że po zaznaczeniu fazy P jest wybierana do zaznaczenia faza S. Dla przykładowych danych z rejonu 'Song Tranch 2' po ustawieniu fazy fali P (kliknięcie myszką), automatycznie ustawia się możliwość ustawienia fali S.
Rys 1. Zaznaczanie faz
Ustawienie opisu wejścia i polaryzacji fali
Istnieje możliwość ustawienia rodzaju wejścia fali Onset (Wejście fali) i Polarity (Polaryzacja). Odpowiednie menu można wywołać w następujący sposób → podczas wyboru fazy przyciskiem Phase na pasku narzędzi w oknie głównym lub podczas wyboru opcji Pick phase z menu rozwijanego → dostępnego po kliknięciu prawym przyciskiem myszkina dany sejsmogram.
W oknie tym można wybrać:
- Phase (Fazę), z listy nazw dopuszczalnych dla danego regionu (patrz konfiguracja).
- Onset (Wejście fali) → Emergent (), Impulsive (), Questionable ()
- Polarity (Polaryzacja) → Positive (Dodatnia), Negative (Ujemna), Undecidable (Nieokreślona).
Wprowadzone zmiany należy zatwierdzić poprzez kliknięcie przycisku OK.
Wybierając fazę przez jedną z ikon wyboru najczęściej wybieranych faz nie mamy możliwości ustawienia wejścia i polaryzacji fali. Przyjmowane są wartości domyślne.
Rys. 7 Okno wyboru fazy sejsmicznej
Edycja fazy
Po ustawieniu fazy można ją wyedytować: tj. zmienić nazwę fazy, opis wejścia lub polaryzację fali. Nazwę fazy można zmienić na dowolną inną nazwę, nawet jeżeli nie jest ona na liście zdefiniowanych faz. Istnieją dwa sposoby edycji fazy:
- W oknie głównym lub oknie powiększenia poprzez wybranie opcji Edit phase ... (Edytuj fazę ...), w miejscu ... pojawi się nazwa zaznaczonej fazy, z menu rozwijanego
→ dostępnego po kliknięciu prawym przyciskiem myszkina danym sejsmogramie w oknie głównym lub oknie powiększenia.
Jeżeli w rozwijanym menu nie pojawi się pozycja edycji danej fazy), to może oznaczać, że pozycja myszki była za daleko od jej znacznika. W takiej sytuacji zalecane jest rozciągnięcie sejsmogramu i powtórne wybranie fazy do edycji. - W oknie opracowania poprzez edycję poszczególnych składowych zaznaczonej fazy wybranie Przez wybranie czynności – kliknięcie prawym przyciskiem myszki na fazie sejsmicznej w oknie opracowania, następnie na wybraniu czynności z rozwijanego menu, przy czym czynności te można wykonywać na pozycji fazy (Pick) lub jej pozycjach składowych (Phase Hint, Onset, Polarity).
Rys. 8 Okno edycji fazy sejsmicznej
Rys. 9
Usuwanie fazy
Istnieją dwa sposoby usuwania fazy:
- Przez kliknięcie prawym przyciskiem myszki na naznaczeniu fali sejsmicznej w oknie głównym lub oknie powiększenia, następnie na wybraniu czynności usuwania z rozwijanego menu. Jeżeli w rozwijanym menu nie pojawi się pozycja Delete phases name (nazwa fazy), to może oznaczać, że pozycja myszki była za daleko od fazy. W takiej sytuacji zalecane jest rozciągnięcie sejsmogramu i powtórne wybranie fazy do edycji.
- Przez wybranie czynności – kliknięcie prawym przyciskiem myszki na fazie sejsmicznej w oknie opracowania, następnie na wybraniu czynności Usuwania z rozwijanego menu, przy czym czynności te można wykonywać na pozycji fazy (Pick).