uruchomienie sesji graficznej pro-viz
# załadowanie modułu pro-viz module add tools/pro-viz # zlecenie sesji graficznej: 1 węzeł x 4 rdzenie na 8 godzin pro-viz start -N1 -n4 -t 8:00:00 # sprawdzenie czy sesja graficzna się uruchomiła pro-viz list # ustawienie hasła dla sesji pro-viz password <jobid>
W momencie kiedy ustawione zostanie hasło, należy zestawić sesje graficzną poprzez klienta VNC. Opis postępowania dostępny jest w sekcji: Obliczenia w trybie graficznym: pro-viz
załadowanie modułu ansys
# załadowanie modułu pro-viz module add test/ansys/18.2 # opcjonalnie dla szybkiego renderingu (przyspiesza operacje graficzne na modelach 3d) module add plgrid/libs/mesa/17.1.0
konfiguracja RSM (krok wykonuje się jednorazowo)
# uruchomienie konfiguratora RSM /software/local/ansys/v182/CYFRONET/rsm/setup_rsm
uruchomienie workbench
# uruchomienie workbench runwb2 # alternatywnie w przypadku załadowania modułu mesa w punkcie 2.: runwb2 -oglhw
Tryb RSM - remote solve manager umożliwia zlecenie zadania na klaster z poziomu sesji graficznej ANSYS workbench.
Pakiet ANSYS pozwala na wysłanie całości projektu do przeliczenia poprzez mechaznim RSM lub wybranych solverów.
Uwaga: obliczenia wymagające wysłania całości projektu w ramach RSM obejmują
Wysłanie całości projektu do RSM wymaga:
Należy pamiętać o zapisaniu projektu po zleceniu zadania do RSM a przed zamknięciem sesji graficznej.
W trybie zlecenia zadań do systemu kolejkowego dostępne są następujące rodzaje kolejek.
Wybór kolejki powinien zależeć od prognozowanego czasu obliczeń.
Kolejki plgrid-short charakteryzują się szybszym czasem uruchomienia dzięki mechanizmowi backfill ale posiadają ograniczenie czasowe czasu trwania zadania
Kolejka AMD polecana jest dla zadań z większymi wymaganiami pamięci na rdzeń.
Nazwa kolejki | max. czas trwania zadania | ilość pamięci na każdy rdzeń zadania | ilość rdzeni na węzeł |
---|---|---|---|
zeus:plgrid:amd | 72 godziny | 4000 MB | 16 |
zeus:plgrid:intel | 72 godziny | 1800 MB | 6 |
zeus:plgrid-short:amd | 1 godzina | 4000 MB | 16 |
zeus:plgrid-short:intel | 1 godzina | 1800 MB | 6 |
Błąd raportowany przez solver fluenta. Oznacza że aplikacja nie mogła we własnym zakresie dokonać przypięcia procesu do konkretnego rdzenia obliczeniowego.
W tym przypadku przypięcie procesu do rdzenia zostało wykonane przez biblioteke MPI w wyniku czego system nie pozwala solverowi na zmianę tego ustawienia - co raportuje program.
W środowisku slurm za izolację rdzeni odpowiada mechanizm cgroups, a przypinanie procesów do rdzeni realizowane jest przez biblioteki MPI.
Komunikat ma wartość informacyjną i nie ma wpływu na wydajność obliczeń
Może się zdarzyć że po wybraniu opcji Update na solverze lub w całym projekcie Workbench oczekuje w nieskonczoność na reakcje RSM, a w oknie Job Monitora (przycisk w prawym dolnym rógu) nie pojawia się oczekiwane zadanie.
Problem związany jest z istnieniem pliku lock z poprzedniej sesji ANSYS. W celu naprawienia problemu uruchamiamy okno terminala i usuwamy niepotrzebny lock-file:
rm ~/.ansys/v182/RSM/Jobs/$USER/DirectoryLocker.lock
Jeżeli workbench został zamknięty w czasie gdy w trybie RSM oczekiwał na zakonczenie zleconego zadania, to po ponowym uruchomieniu workbencha należy kliknąć przycisk Reconnect zlokalizowany w lewym górnym rogu ekranu aby pobrać przeliczone wyniki.