Page tree
Skip to end of metadata
Go to start of metadata

Ważne informacje

Usługa znajduje się w fazie pre-produkcyjnej - dlatego prosimy o wyrozumiałośc i zgłaszanie wszelkich zaobserwowanych nieprawidłowości

Z uwagi na małą przestrzeń dyskową w katalogach domowych ($HOME) prosimy o przechowywanie inputów ANSYS w katalogach grup $PLG_GROUPS_DIR/<nazwagrupy> lub w katalogu $SCRATCH na systemie plików Lustre.


Przekroczenie limitów dyskowych jest przyczyną 80% problemów z działaniem oprogramowania.

Procedura uruchomienia pakietu ANSYS

  1. uruchomienie sesji graficznej pro-viz

    uruchomienie sesji pro-viz
    # załadowanie modułu pro-viz
    module add tools/pro-viz
    # zlecenie sesji graficznej: 1 węzeł x 4 rdzenie na 8 godzin
    pro-viz start -N1 -n4 -t 8:00:00
    # sprawdzenie czy sesja graficzna się uruchomiła
    pro-viz list
    # ustawienie hasła dla sesji
    pro-viz password <jobid>

    W momencie kiedy ustawione zostanie hasło, należy zestawić sesje graficzną poprzez klienta VNC. Opis postępowania dostępny jest w sekcji: Obliczenia w trybie graficznym: pro-viz

  2.  załadowanie modułu ansys

    ładowanie modułów ANSYS
    # załadowanie modułu pro-viz
    module add test/ansys/18.2
    # opcjonalnie dla szybkiego renderingu (przyspiesza operacje graficzne na modelach 3d)
    module add plgrid/libs/mesa/17.1.0
  3. konfiguracja RSM (krok wykonuje się jednorazowo)

    konfigurator RSM dla ANSYS
    # uruchomienie konfiguratora RSM
    /software/local/ansys/v182/CYFRONET/rsm/setup_rsm
  4. uruchomienie  workbench

    konfigurator RSM dla ANSYS
    # uruchomienie workbench
    runwb2 
    # alternatywnie w przypadku załadowania modułu mesa w punkcie 2.:
    runwb2 -oglhw


Tryb RSM

Tryb RSM - remote solve manager umożliwia zlecenie zadania na klaster z poziomu sesji graficznej ANSYS workbench.

Pakiet ANSYS pozwala na wysłanie całości projektu do przeliczenia poprzez mechaznim RSM lub wybranych solverów.

Uwaga: obliczenia wymagające wysłania całości projektu w ramach RSM obejmują

  • static structural
  • system coupling

Wysłanie całości projektu do RSM wymaga:

  • przestawienia solverów w tryb default Solution>Properties>Solution Process>Update Option: Use Application Default
  • ustawienia Solution Process dla Project Schematic na RSM (preferencje pojawiają sie po wybraniu Properties w menu kontekstowym po kliknięciu prawym klawiszem na białym polu okna project schematic)

Należy pamiętać o zapisaniu projektu po zleceniu zadania do RSM a przed zamknięciem sesji graficznej.

RSM: przetestowane moduły

Pakiet ANSYS jest złożonym produktem zbudowanym z wielu komponentów.
Tryb RSM może nie być wspierany dla wszystkich z nich lub może nie działać prawidłowo w naszym środowisku.
Komponenty z listy poniżej zostały przetestowane w trybie jedno i wielo węzłowym w trybie RSM:

  • Fluent
  • CFX
  • Ansys
  • Static structural (mogą pojawić się problemy w trybie wielowęzłowym - zalecane jest używanie trybu Shared Memory Parallel w ustawieniach solvera)

Jeżeli używany przez państwa komponent nie pojawia się na w/w liście prosimy o sprawdzenie jego działania i informacje w przypadku napotkanych problemów

Kolejki obliczeniowe

W trybie zlecenia zadań do systemu kolejkowego dostępne są następujące rodzaje kolejek.
Wybór kolejki powinien zależeć od prognozowanego czasu obliczeń.

Kolejki plgrid-short charakteryzują się szybszym czasem uruchomienia dzięki mechanizmowi backfill ale posiadają ograniczenie czasowe czasu trwania zadania

Kolejka AMD polecana jest dla zadań z większymi wymaganiami pamięci na rdzeń.

Kolejki dostępne na klastrze zeus

Nazwa kolejkimax. czas trwania zadaniailość pamięci na każdy rdzeń zadaniailość rdzeni na węzeł
zeus:plgrid:amd72 godziny

4000 MB

16

zeus:plgrid:intel

72 godziny1800 MB6
zeus:plgrid-short:amd1 godzina4000 MB16
zeus:plgrid-short:intel1 godzina1800 MB6

Kolejki dostępne na klastrze prometheus


Znane błędy

FLUENT: sched_setaffinity() call failed: Invalid argument

Błąd raportowany przez solver fluenta. Oznacza że aplikacja nie mogła we własnym zakresie dokonać przypięcia procesu do konkretnego rdzenia obliczeniowego.
W tym przypadku przypięcie procesu do rdzenia zostało wykonane przez biblioteke MPI w wyniku czego system nie pozwala solverowi na zmianę tego ustawienia - co raportuje program.

W środowisku slurm za izolację rdzeni odpowiada mechanizm cgroups, a przypinanie procesów do rdzeni realizowane jest przez biblioteki MPI.
Komunikat  ma wartość informacyjną i nie ma wpływu na wydajność obliczeń

Problem w wysyłaniem zadania w trybie RSM

Może się zdarzyć że po wybraniu opcji Update na solverze lub w całym projekcie Workbench oczekuje w nieskonczoność na reakcje RSM, a w oknie Job Monitora (przycisk w prawym dolnym rógu) nie pojawia się oczekiwane zadanie.
Problem związany jest z istnieniem pliku lock z poprzedniej sesji ANSYS. W celu naprawienia problemu uruchamiamy okno terminala i usuwamy niepotrzebny lock-file:


RSM: usuwanie pliku lock
rm  ~/.ansys/v182/RSM/Jobs/$USER/DirectoryLocker.lock

Zadanie znika z Job Monitora po zamknięciu sesji

Jeżeli workbench został zamknięty w czasie gdy w trybie RSM oczekiwał na zakonczenie zleconego zadania, to po ponowym uruchomieniu workbencha należy kliknąć przycisk Reconnect zlokalizowany w lewym górnym rogu ekranu aby pobrać przeliczone wyniki.


Zgłaszanie problemów w działaniu oprogramowania

Przed zgłoszeniem problemu prosimy upewnić się że:

  • w czasie wystąpienia problemu nie została przekroczona quota dyskowa. Informacje otrzyujemy wywołując na maszynie dostępowej klastra (zeus.cyfronet.pl / pro.cyfronet.pl)  polecenie:

    raport użycia systemów plikowych
    # klaster zeus:
    zeus-fs
    # klaster prometheus:
    pro-fs
  • użytkownik posiada aktywny grant obliczeniowy

    raport użycia systemów plikowych
    plg-show-grants

Zaobserwowane problemy i błędy prosimy zgłaszać przez system helpdesk - helpdesk.plgrid.pl podając następujące informacje:

  • opis problemu i opcjonalnie zrzut ekranu ilustrujący napotkany problem
  • numer zadania z sesją graficzną w której wystąpił problem
  • wskazanie katalogu z plikami inputowymi zadania


  • No labels