Infrastruktura QosCosGrid
Infrastruktura QosCosGrid jest zestawem zintegrowanych, wysoce wydajnych usług i narzędzi dostępowych do zarządzania zasobami i zadaniami w wieloklastrowych i gridowych środowiskach obliczeniowych. QosCosGrid wspiera różne scenariusze dla aplikacji, w tym aplikacji równoległych dużej skali, aplikacji parametrycznych oraz złożonych aplikacji typu workflow. Usługi QosCosGrid umożliwiają logiczne scalenie zasobów obliczeniowych pochodzących z wielu klastrów w jeden rozproszony system obliczeniowy. Pozwala to na skrócenie czasu oczekiwania na przydział zasobów oraz na uruchamianie różnego typu zadań obliczeniowych o wymaganiach przekraczających możliwości pojedynczego klastra. Poprzez wykorzystanie zaawansowanych mechanizmów rezerwacji zasobów z wyprzedzeniem, usługi QosCosGrid gwarantują użytkownikowi wymaganą jakość usług obliczeniowych (ang. Quality of Service), w tym czas wykonania zadania. Usługi QosCosGrid zostały w pełni zintegrowane z infrastrukturą PL-Grid umożliwiając polskiemu środowisku naukowemu, dzięki dziedzinowym rozwiązaniom portalowym, intuicyjny i łatwy dostęp do zasobów polskiego gridu obliczeniowego.
Zalety korzystania z usług dostępowych QCG
- prostota i intuicyjność korzystania (polecenia qcg-*)
- prosty format opisu zadań,
- dostęp do wszystkich zasobów infrastruktury PL-Grid z jednego miejsca,
- nowatorska funkcjonalność,
- powiadamiania o stanie zadania poprzez pocztę (e-mail) lub z wykorzystaniem komunikatora (Jabber - protoków XMMP),
- stabilność,
- rozszerzalność.
- pełne wsparcie przez grupę twórców usług QCG.
Usugi QCG tworzone są w ramach projektu PL Grid PLUS przez grupę progrmistów z Poznańskiego Centrum Suprkomputerowo-Sieciowego.
Unikalna funkcjonalność usług QCG
- Wsparcie dla zadań interaktywnych.
- Możliwość "podłączania się" interaktywną sesją do wcześniej uruchomionych zadań.
- Gwarancja wymaganej jakości usług obliczeniowych (ang. Quality of Service), w tym czasu wykonania zadania poprzez wykorzystanie zaawansowanych mechanizmów rezerwacji zasobów z wyprzedzeniem.
- Logiczne scalanie zasobów obliczeniowych pochodzących z wielu klastrów w jeden rozproszony system obliczeniowy.
- Skrócenie czasu oczekiwania na przydział zasobów oraz umożliwienie uruchamiania różnego typu zadań obliczeniowych o wymaganiach przekraczających możliwości pojedynczego klastra poprzez wykorzystanie (koalokację) wielu zasobów.
- Możliwość rezerwowania zasobów obliczeniowych i uruchamiania zadań na wcześniej zarezerwowanych zasobach.
- Integracja ze środowiskami uruchomieniowymi: OpenMPI, ProActive, Muscle.
- Wsparcie dla zadań hybrydowych MPI/OpenMP.
- Możliwość definiowania złożonych zależności kolejnościowych pomiędzy zadaniami w eksperymentach typu workflow (z użyciem operatorów AND/OR i dowolnych stanów zadań).
- Możliwość definiowania zadań parametrycznych jako części eksperymentu typu workflow.
Dostępne zasoby
Obecnie poprzez usługi QosCosGrid możliwy jest dostęp do zasobów następujących ośrodków obliczeniowych wchodzących w skład infrastruktury projektu PL-Grid:
- PCSS - Poznańskie Centrum Superkomputerowo Sieciowe - klaster reef, inula
- WCSS - Wrocławskie Centrum Sieciowo Superkomputerowe - klaster supernova
- Cyfronet AGH - Akademickie Centrum Komputerowe Cyfronet AGH - klaster Zeus
- CI TASK - Centrum Informatyczne Trójmiejskiej Akademickiej Sieci Komputerowej -klaster galera plus
- ICM - Interdyscyplinarne Centrum Modelowania Matematycznego UW - klaster hydra.
Nazwy klastrów obliczeniowych w poszczególnych ośrodkach do podania w opisie eksperymentu przy zlecaniu go do wykonania w konkretnym ośrodku.
Usługi QCG akceptują zarówno pełna nazwę jak i skórcony alias.
| Ośrodek | Klaster | Pełna nazwa QCG | Krótki alias QCG |
|---|---|---|---|
| PCSS | reef | reef.man.poznan.pl | reef |
| PCSS | inula | inula.man.poznan.pl | inula |
| WCSS | supernova | nova.wcss.wroc.pl | nova |
| Cyfronet AGH | zeus | zeus.cyfronet.pl | zeus |
| CI TASK | galera plus | galera.task.gda.pl | galera |
| ICM | hydra | hydra.icm.edu.pl | hydra |
Przed zleceniem zadania prosimy o zapoznanie się ze szczegółowymi informacjami dotyczącymi:
Korzystanie z infrastruktury
Aby móc skorzystać z infrastruktury QosCosGrid należy:
- skorzystać z wybranej metody dostępowej:
Aplikowanie o usługę
Aby móc skorzystać z zasobów projektu PL-Grid z wykorzystaniem usług dostępowych QosCosGrid konieczne jest wystąpienie o dostęp do infrastruktury QosCosGrid poprzez wykonanie prostej sekwencji kroków.
Klient tekstowy
Dostęp do infrastruktury QCG możliwy jest z dowolnego komputera, na którym zainstalowany jest klient usługi QCG-Broker (będącej częścią infrastruktury QCG), służący do zlecania i kontrolowania zadań na poziomie całego gridu. Dla wygody użytkowników klient QCG zainstalowany został w infrastrukturze PL-Grid na kilku maszynach dostępowych do infrastruktury QCG.
Dokumentacja dotycząca klienta tekstowego dostępna jest pod adresem: https://docs.plgrid.pl/qcg-client
Formaty opisu zadań
Każdy eksperyment obliczeniowy, zlecany do wykonania na infrastrukturze QosCosGrid, musi być opisany przez dokument w jednym z akceptowanych formatów, zwany później „opisem zadania”. Infrastruktura QCG akceptuje opisy zadań wyrażone w:
- języku
QCG-Simple(remomendowany dla QCG-SimpleClient) - prosty opis w postaci pliku tekstowego, w którym każda linia może zawierać dyrektywę interpretowaną przez system QCG. Uproszczony opis przeznaczony jest do zlecania najczęściej wykonywanych zadań, nie oferuje jednak dostępu do całej funkcjonalności systemy (brak wsparcia dla kaskad zadań (ang. workflow) i zadań parametrycznych (ang. parameter sweep)). - języku
QCG-JobProfilezdefiniowanym formalnie przez schemat XML - QCG-JobProfile. QCG-JobProfile przeznaczony jest dla zaawansowanych użytkowników w przypadku braku wymaganej funkcjonalności w opisie QCG-Simple! W przypadku checi skorzystania z QCG-JobProfile prosimy o indywidualny kontakt z zespołem QCG. - języku
JSDL(Job Submission Description Language) z rozszerzeniemHPC Basic Profile.
Maszyny dostępowe QCG
Dla wygody użytkowników klient usługi QCG-Broker zainstalowany został na ogólnodostępnych (dla użytkowników infrastruktury QCG) maszynach.
Jednocześnie, maszyny dostępowa QCG udostępniają przestrzeń dyskową poprzez protokół gridFTP.Przestrzeń ta może być wykorzystana zarówno do przechowywania plików wejściowych, jak i wyników eksperymentów.
Użytkownik i hasło dla wszystkich maszyn dostępowych są takie same jak w portalu PL-Grid. Dostęp do maszyn QCG jest poprzez usługe SSH.
Logowanie: ssh <plguser>@maszyna.dostepowa
np.
ssh plgpiontek@qcg.man.poznan.pl
Lista maszyn dostępowych do infrastruktury QosCosGrid
| Ośrodek | PCSS, Poznań | WCSS, Wrocław | Cyfronet, Kraków | ICM, Warszawa |
|---|---|---|---|---|
| Maszyna | qcg.man.poznan.pl | ui.plgrid.wcss.wroc.pl | zeus.cyfronet.pl | ui.grid.icm.edu.pl |
| Port dostępowy | 22 | 22 | 22 | 22 |
| Komentarz | czasowe problemy z wydajnością dostępu do systemu plików | |||
| Zgłaszanie problemów | ||||
Po zalogowaniu przed pierwszym użyciem klienta konieczna jest konfiguracja środowiska użytkownika zgodnie z wytycznymi opisanymi na maszynie dostępowej.
Do wyświetlenia informacji opisującej konfigurację środowiska wymaganą przed pierwszym uruchomieniem służy polecenie - qcg_how_to_start.
[qcg] /home/plgrid/plgpiontek/reef > qcg_how_to_start
Dostęp do infrastruktury QCG wymaga od użytkownika posiadania odpowiednich certyfikatów.
Infrastruktura QCG umożliwia dostęp do zasobów projektu PL-GRID na podstawie:
1) certyfikatów generowanych w portalu PL-GRID - Simple CA (format p12)
2) certyfikatów wystawionych przez "Polish Grid CA" (format PEM).
Konfiguracja środowiska QCG odbywa się poprzez jednokrotne wywołanie odpowiedniej wersji polecenia:
1) qcg_set_env plg<uzytkownik>.p12
2) qcg_set_env usercert.pem userkey.pem
Po ponownym zalogowaniu się poprawność konfiguracji można zweryfikowac poleceniem "qcg-client description".
Polecenie to powinno wyświtlić nazwe i wersję usługi QCG-Broker.
UWAGA: W przypadku posiadanie klucza certyfikatu w niewspieranym formacie konieczna jest jego konwersja poleceniami:
Jeżeli plik z kluczem prywatnym uzytkownika rozpoczyna sie linia: "-----BEGIN ENCRYPTED PRIVATE KEY-----" konieczne jest kownersja następującymi poleceniami.
1) Konwersja do właściwego formatu
openssl pkcs8 -in userkey.pem -out userkey_new.pem
2) Ponowne zabezpieczenie klucza hasłem:
openssl rsa -in userkey_new.pem -des3 -out userkey.pem
Po zakonczonym procesie konwersji i kodowania klucz powienien rozpoczynac sie nagłówkiem: "-----BEGIN RSA PRIVATE KEY-----"
Graficzne narzędzia dostępowe
Dostęp do infrastruktury QosCosGrid możliwy jest również z wykorzystaniem dedykowanych narzędzi graficznych ułatwiających przeprowadzenie eksperymentu obliczeniowego oraz interpretacji wyników:
 |
QCG-Icon |
 |
Nanotechnology-Gateway |
Overview
Content Tools