Page History
...
| Code Block |
|---|
qcg-refetch J1331196390748_date_3099 |
Przykładowe opisy zadań
Uruchomienie na klastrze galera aplikacji „gaussian”.
| Code Block |
|---|
#QCG queue=plgrid-long
#QCG name=etanal
#QCG note=etanal Gaussian
#QCG output=${JOB_ID}.output
#QCG error=${JOB_ID}.error
#QCG stage-in-file=etanal.gjf -> etanal.gjf
#QCG stage-out-file=wynik.tar -> ${JOB_ID}.tar
#QCG nodes=1:12
#QCG host=galera.task.gda.pl
#QCG persistent
#QCG walltime=P7D
#QCG notify=mailto:piontek@man.poznan.pl
#QCG memory=15360
#QCG preprocess=echo START
#QCG application=g09
#QCG argument=etanal.gjf
#QCG postprocess=tar cvf wynik.tar *
|
Eksperyment polegający na:
- przegraniu z katalogu, z którego wykonano polecenie qcg-sub podkatalogu inputs na klaster na docelowy klaster (reef).
- zleceniu do wykonania na klastrze reef w kolejce plgrid polecenia /bin/tar pakującego przegrany wczesnej katalog inputs do pliku output.tgz.
- przesłaniu pliku output.tgz do katalogu, z którego wykonano polecenie qcg-sub pod tę samą nazwę.
| Code Block |
|---|
#!/bin/bash
#QCG queue=plgrid
#QCG persistent
#QCG host=reef.man.poznan.pl
#QCG output=output
#QCG error=error
#QCG stage-in-dir=inputs -> inputs
/bin/tar -czf output.tgz inputs/input.*
#QCG stage-out-file=output.tgz -> output.tgz |
Uruchomienie aplikacji NAMD
| Code Block |
|---|
#QCG note=NAMD apoa1
#QCG name=ex_1
#QCG host=hydra.icm.edu.pl
#QCG walltime=PT10M
#QCG queue=plgrid
#QCG nodes=1:12:12
#QCG persistent
#QCG output=apoa1.output
#QCG error=apoa1.error
#QCG application=NAMD
#QCG argument=apoa1/apoa1.namd
#QCG stage-in-file=apoa1.zip
#QCG preprocess=unzip apoa1.zip
#QCG stage-out-dir=. -> results
#QCG notify=xmpp:tomasz.piontek@plgrid.pl
#QCG watch-output=mailto:tp@mail,20,ENERGY |
Overview
Content Tools