Versions Compared

Key

  • This line was added.
  • This line was removed.
  • Formatting was changed.
Section
Column

Column


QCG-SimpleClient oferuje prosty, wzorowany na poleceniech poleceniach systemu kolejkowego, interfejs do infrastruktury QCG.

Table of Contents
maxLevel3
classmenu-right

 

Warning

Wszystkie przykłady prezentowane na tej stronie mają na celu przedstawienie możliwego opisu zadania dla danej aplikacji.

Nie stanowią rekomendacji i są tylko przykładami, które można dowolnie rozszerzać i modyfikować.

W większości przypadków do uruchomienia tych zadań konieczne są pliki wejściowe, które są tu dostarczane.

 

Aplikacji ABINIT

Code Block
#QCG queue=plgrid-long
#QCG note=4QLsTi+Ni_h3
#QCG output=myjob.log
#QCG error=myjob.error
#QCG stage-in-file=Bi2Se3.in
#QCG stage-in-file=Bi2Se3x.files
#QCG stage-in-file=34se.6.hgh
#QCG stage-in-file=83bi.5.hgh
#QCG stage-in-file=22ti.4.hgh
#QCG stage-in-file=28ni.10.hgh
#QCG stage-out-dir=. -> results-${JOB_ID}
#QCG nodes=1:8
#QCG memory=12000
#QCG host=hydra
#QCG walltime=P7D
#QCG application=abinit
#QCG argument=Bi2Se3x.files
#QCG grant=moj_grant

...

Code Block
#QCG note=NAMD apoa1
#QCG name=ex_1                                                            
#QCG host=hydra.icm.edu.pl                                                
#QCG walltime=PT10M                                                       
#QCG queue=plgrid                                                         
#QCG nodes=1:12:12                                                        
#QCG persistent                                                           
#QCG output=apoa1.output                                                  
#QCG error=apoa1.error                                                    
#QCG application=NAMD                                                     
#QCG argument=apoa1/apoa1.namd                                            
#QCG stage-in-file=apoa1.zip                                              
#QCG preprocess=unzip apoa1.zip                                           
#QCG stage-out-dir=. -> results                                        
#QCG notify=xmpp:tomasz.piontek@plgrid.pl  
#QCG watch-output=mailto:tp@mail,20,ENERGY

Aplikacja R

Code Block
#QCG host=zeus
#QCG queue=plgrid
#QCG walltime=PT5M
#QCG application=R
 
#QCG output=${JOB_ID}.output
#QCG error=${JOB_ID}.error
#QCG argument=PoDA-example.R
#QCG stage-in-file=PoDA-example.R
#QCG stage-in-file=PoDA.R 
#QCG stage-in-file=PoDA-example-data.RData
#QCG stage-out-file=Rplots.pdf

 

Konwersja pliku tekstowego

...