Definicja zadania

Zadanie, którego postęp wykonania ma być monitorowany musi zawierać dyrektywę "#QCG watch-output".

Dyrektywa ta odpowiedzialna jest za poinformowanie systemu o konieczności uruchomienia dodatkowego procesu monitorującego aplikację.

Jednym z argumentów dyrektywy "watch-output" jest skrypt monitorujący.

Skrypt monitorujący

Skrypt monitorujący postęp aplikacji uruchamiany jest automatycznie, cyklicznie przez środowisko QCG.Rolą tego skrypty jest wyszukanie zadanej informacji i przekazanie jej w odpowiednim formacie na standardowe wyjście. Informacja ta ze standardowego wyjścia jest przechwytywana i wysyłana do usługi QCG-Monitor.

Skrypt monitorujący musi być przesłany wraz z zadaniem za pomocą dyrektywy "#QCG stage-in-file".

Format wyjścia skryptu monitorującego

Wyjście skryptu monitorującego w pierwszej linii musi zawierać definicję formatu pozostałych danych w postaci

qcg.monitor.scheme=format

gdzie format jest jednym z predefiniowanych formatów rozumianych przez usługę QCG-Monitor.

Schematy danych

generic

• generic - dane wyświetlane są w niezmienionej formie. Kolejne dane dopisywane są do poprzednich.

generic2

• generic2 - dane wyświetlane są w niezmienionej formie. Kolejne dane zastępują poprzednie.

gaussian

• gaussian - schemat prezentujący tabele i wykres dla energii wyznaczonej przez aplikację gaussian.
  

Skrypt monitorujący:

#!/bin/bash
echo 'qcg.monitor.scheme=gaussian'
grep "SCF Done:" _stdouterr | awk '{print $5}'

gaussian_ext

• gaussian_ext - rozszerzony monitoring aplikacji gaussian.
  
  Skrypt monitorujący

  #!/bin/bash
  echo 'qcg.monitor.scheme=gaussianext'
  echo "#energy#"
  grep "SCF Done:" _stdouterr | awk '{print $5}'
  echo "#force#"
  grep "^ Maximum Force" _stdouterr | awk '{print $3}'
  echo "#maxdispl#"
  grep "^ Maximum Displacement" _stdouterr | awk '{print $3}'
  echo "#rmsdispl#"
  grep "^ RMS     Displacement" _stdouterr | awk '{print $3}'

Przykładowe zadanie

Dostęp do portalu wizualizacyjnego