QCG-SimpleClient oferuje prosty, wzorowany na poleceniech systemu kolejkowego, interfejs do infrastruktury QCG.
Zlecenie zadania do wykonania na infrastrukturze QCG zgodnie z uproszczonym opisem
plik_z_opisem - ścieżka do pliku z uproszczonym opisem zadania
qcg-sub /home/piontek/tasks/date.qcg qcg-sub ./tasks/date.qcg
qcg-list czas_jednostka [stan,[stan]]
Wyświetlenie listy zleconych zadań wraz z informacjami o nich.
czas_jednostka - Opcjonalnie można podać z jakiego czasu mają być zadania - z ostatnich „liczba” dni („d”), godzin („h”), minut („m”).
stan - Drugim opcjonalnym parametrem jest lista stanów zadań oddzielonych przecinkami (bez spacji). W przypadku niepodania stanów wyświetlane są zadania niezakończone.
qcg-list qcg-list 7d qcg-list 1m qcg-list 7d finished qcg-list 1m finished,failed
Dla wygody użytkowników zamiast listy stanów możliwe jest podanie zdefiniowanych stałych:
qcg-list 7d all qcg-list 7d terminated qcg-list 7d unterminated
qcg-info jobId pokaz_opis
Wyświetlenie szczegółowej informacji o danym zadaniu.
jobId - identyfikator eksperymentu.
pokaz_opis- Jeśli pokaz_opis ma wartość „true” to dodatkowo wyświetlany jest opis zadnia. Domyślną wartością jest „false”.
qcg-info J1331196390748_date_3099 true
gcg-peek jobId liczba_znaków
Podgląd wyjścia (stdout, stderr) aplikacji.
jobId - identyfikator eksperymentu,
liczba_znaków- liczba znaków do wyświetlenia,
qcg-peek J1331196390748_date_3099 qcg-peek J1331196390748_date_3099 10
qcg-proxy
Utworzenie certyfikatu proxy użytkownika.
qcg-proxy
qcg-cancel jobId
Anulowanie zadania.
jobId - identyfikator eksperymentu
qcg-cancel J1331196390748_date_3099
qcg-clean jobId
Usunięcie katalogu roboczego zadnia.
jobId - identyfikator eksperymentu
qcg-clean J1331196390748_date_3099
qcg-interactive plik_z_opisem
Zlecenie zadania interaktywnego.
plik_z_opisem - ścieżka do pliku z uproszczonym opisem zadania
qcg-interactive /home/piontek/tasks/bash.qcg qcg-interactive ./tasks/bash.qcg
Korzystając z polecenia qcg-interactive można zlecić wykonanie dowolnej interaktywnej tekstowej aplikacji.
Szczególnie częstym i użytecznym przypadkiem jest interaktywne uruchomienie konsoli poleceń umożliwiające np. kompilację oprogramowani na klastrze, do którego nie ma dostępu poprzez SSH.
W opisie zadania dla interaktywnego uruchomienia konsoli poleceń wystarczy podać nazwę klastra, na którym ma sie uruchomić konsola oraz podać scieżkę do preferowanego interpretera poleceń (np. bash).
#QCG host=inula.man.poznan.pl /bin/bash
W opisie zadania interaktywnego można korzystać również z innych dyrektyw QCG celem podania np. wymagań zasobowych dla zadania interaktywnego.
qcg-connetct jobId
Utworzenie z klienta QCG interaktywnej sesji w katalogu roboczym danego zadania
jobId - identyfikator eksperymentu
qcg-connect J1331196390748_date_3099
qcg-refetch jobId
Ponowne skopiowanie plików wynikowych zadania.
jobId - identyfikator eksperymentu
qcg-refetch J1331196390748_date_3099
Uruchomienie na klastrze galera aplikacji „gaussian”.
#QCG queue=plgrid-long #QCG name=etanal #QCG note=etanal Gaussian #QCG output=${JOB_ID}.output #QCG error=${JOB_ID}.error #QCG stage-in-file=etanal.gjf -> etanal.gjf #QCG stage-out-file=wynik.tar -> ${JOB_ID}.tar #QCG nodes=1:12 #QCG host=galera.task.gda.pl #QCG persistent #QCG walltime=P7D #QCG notify=mailto:piontek@man.poznan.pl #QCG memory=15360 #QCG preprocess=echo START #QCG application=g09 #QCG argument=etanal.gjf #QCG postprocess=tar cvf wynik.tar *
Eksperyment polegający na:
#!/bin/bash #QCG queue=plgrid #QCG persistent #QCG host=reef.man.poznan.pl #QCG output=output #QCG error=error #QCG stage-in-dir=inputs -> inputs /bin/tar -czf output.tgz inputs/input.* #QCG stage-out-file=output.tgz -> output.tgz
Uruchomienie aplikacji NAMD
#QCG note=NAMD apoa1 #QCG name=ex_1 #QCG host=hydra.icm.edu.pl #QCG walltime=PT10M #QCG queue=plgrid #QCG nodes=1:12:12 #QCG persistent #QCG output=apoa1.output #QCG error=apoa1.error #QCG application=NAMD #QCG argument=apoa1/apoa1.namd #QCG stage-in-file=apoa1.zip #QCG preprocess=unzip apoa1.zip #QCG stage-out-dir=. -> results #QCG notify=xmpp:tomasz.piontek@plgrid.pl #QCG watch-output=mailto:tp@mail,20,ENERGY