...
...
assistant - dyrektywa umożliwiająca uruchomienie równolegle z podstawowym programem polecenia lub skryptu pomocniczego. Skrypt ten zakończony zostanie automatycznie z końcem zadnia.
Warning |
---|
Dyrektywa wprowadzona została w wersji 3.4 i zastąpiła dyrektywę #QCG monitor, która zmieniła znaczenie. |
Składnia:
Code Block |
---|
#QCG assistant=skrypt,delay->N #QCG assistant=script->skrypt,delay->N |
Parametry:
script - obligatoryjny, domyślny parametr definiujący
polecenie lubskrypt, który ma być uruchomiony. W przypadku korzystania ze skryptu musi być on przegrany dyrektywą #QCG stage-in-file
.delay - opconoalny parametr definiujący okres czasu w sekundach pomiędzy kolejnymi wywołaniami.
Code Block |
---|
#QCG assistant=rm *.temp,delay->60
#QCG assistant=script->skrypt.sh,delay->60
#QCG stage-in-file=script.sh |
Note |
---|
WAŻNE: Skrypt uruchamiany jest jednokrotnie na początku zadania. Jeżeli akcja zdefiniowana wewnątrz skryptu ma być wywoływana cyklicznie użytkownik jest odpowiedzialny za implementacje takiej funkcjonalności. |
...
Code Block |
---|
#QCG module=nwchem/6.0 #QCG module=namd |
monitor - dyrektywa umożliwiająca monitorowanie stanu i postępu wykonania zadania w infrastrukturze QCG z wykorzytaniem usługi QCG-monitoring.
Warning |
---|
Dyrektywa #QCG monitor od wersji QCG 3.4 zmieniła znaczenie. Poprzednia funkcjonalność dostępna jest poprzez dyrektywę #QCG assistant. |
Składnia:
Code Block |
---|
#QCG monitor[=skrypt] #QCG monitor=script->skrypt[,delay->N] |
...
Code Block |
---|
#QCG monitor=gaussian,delay->60 #QCG monitor=script->gaussian,delay->60 |
...
mount - dyrektywa umożliwiając automatyczne zamontowanie dla zadania określonej usługi składowania danych.
Aktualnie jedynym wspieranym systemem jest veilFS.
Code Block |
---|
#QCG mount=veilfs[->katalog] |
Opcjonalny parametr katalog pozwala zdefiniować nazwę katalogu w którym ma być zamontowany system. Domyślą wartością jest "mount".
Code Block |
---|
#QCG mount=veilfs->veilFS_dir |
...
...
Code Block |
---|
#QCG output=gsiftp://qcg.man.poznan.pl//home/plgrid/plgpiontek/reef/outputs/${JOB_ID}.output
#QCG output=output.txt
|
parameter-sweep -dyrektywa umożliwiająca zdefiniowanie przestrzeni parametrów dla zadania. Dyrektywa może być użyta wielokrotnie definiując wielowymiarową przestrzeń parametrów. Dla każdego zestawu parametrów uruchamiane jest osobne zadanie. Dyrektywa skład się z nazwy zmiennej, która będzie przyjmować kolejne wartości oraz z definicji zmienności parametru.
Code Block |
---|
#QCG parameter-sweep=VAR->PARAMETER_SPACE |
Dyrektywa dopuszcza następujące sposoby definiowania zmienności parametru:
list - wartości podane są jako lista oddzielona przecinkami
Code Block |
---|
#QCG parameter-sweep=var->list:mon,tue,wed,thu,fri,sat,sun
#QCG parameter-sweep=var->list:1,2,3,4,5,6 |
for - wartość wyznaczane są od wartości początkowej (start) do końcowej (end) z opcjonalnie definiowalnym krokiem (step) (domyślnie 1). Liczba miejsc po przecinku wyznaczana jest jako największa liczba cyfr po przecinku dla parametrów start, end, step.
Code Block |
---|
#QCG parameter-sweep=var->for:start..end
#QCG parameter-sweep=var->for:start..end..step
#QCG parameter-sweep=var->for:0..10
#QCG parameter-sweep=var->for:0..10..2
#QCG parameter-sweep=var->for:1.0..2.0..0.5 |
pattern - kolejne wartości przyjmują nazwy plików zgodnych z podanym wzorcem wyszukiwanych względem katalogu, z którego zlecono zadanie.
Code Block |
---|
#QCG parameter-sweep=var->pattern->*.input |
file - kolejnymi wartościami są kolejne linie pobierane z pliku
Code Block |
---|
#QCG parameter-sweep=var->file:file_with_values.txt |
persistent - dyrektywa określająca że po zakończeniu zadania system ma pozostawić katalog roboczy, w którym wykonywane było zadanie.
Warning |
---|
Dyrektywa ta powinna być używana tylko na etapie testowania. Przy normalnym trybie wykonywania aplikacji dyrektywa ta nie powinna być ustawiona, gdyż powoduje, że katalog roboczy zadania nie jest usuwany i zajmuje miejsce na zasobach. Zadania zlecone jako "persistent" mogą być po zakończeniu "wyczyszczone" poleceniem qcg-clean. |
...
Code Block |
---|
#QCG watch-output=consumer->konsument,[regexppattern->wyrazenie | script->skrypt ,delay->N] #QCG watch-output=konsument |
...
Code Block |
---|
#QCG watch-output=mailto:piontek@man.poznan.pl,regexppattern->ENERGY,dalay->60 #QCG watch-output=consumer->mailto:piontek@man.poznan.pl,script->skrypt_monitorujacy.sh,dalay->60 #QCG stage-in-file=skrypt_monitorujacy.sh |
...